Фамилия Фисура — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычных русских суффиксов -ов или -ин, что сразу указывает: перед нами не типичная «патронимическая» фамилия от имени отца, а скорее прозвищная, застывшая в форме, близкой к исходному слову. Искать корень стоит в южнорусских и украинских говорах, где слово «фисура» могло быть искажённой формой слова «фигура». В диалектной речи «фисура» (или «хисура») звучала как насмешливое прозвище для человека странного, необычного вида или с причудами в поведении — этакого «чудака» или «фигляра». Человек с таким прозвищем мог быть заметным, выделяться из толпы, возможно, даже кривляться или носить нелепую одежду.

Другая, менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с профессиональным термином. В строительном деле и геологии «фиссура» (от лат. fissura — трещина) — это трещина, щель, разлом. Однако превращение этого книжного термина в прозвище маловероятно для крестьянской среды. Скорее всего, здесь сыграла роль народная этимология: малограмотный писарь, записывая прозвище «Фигура» на слух, мог передать его как «Фисура» — под влиянием местного произношения, где «г» переходила в «х» или вовсе пропадала.

Фамилия Фисура почти не встречается в центральных и северных областях России. Её ареал — Украина, особенно западные и центральные регионы, а также приграничные с Украиной южные области России (Белгородская, Воронежская, Ростовская). Встречаются носители и в Беларуси. Это фамилия-одиночка, не образующая гнезда однокоренных (нет Фисуровых, Фисуриных — только сама Фисура). Такая модель характерна для украинских прозвищных фамилий, которые не склонялись по падежам как прилагательные, а закреплялись в форме существительного. Предок носителя этой фамилии, скорее всего, был человеком с яркой внешностью или нестандартным поведением, за что и получил своё необычное прозвище.