Фамилия Фломина — женская форма, мужская соответственно Фломин. Она образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от основы на согласный (в данном случае «Флом-») с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Фломина, дочь Фломина). Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин так же частотны, как на -ов.

Корень фамилии — прозвище или неканоническое имя Флома. Слово «флома» в русских говорах не имеет однозначного значения, но есть несколько версий его происхождения. Самая вероятная — связь с глаголом «фломать» или «фломить», что в диалектах означало «шататься, болтаться без дела», «праздно ходить». В таком случае Флома — прозвище непоседливого, праздного человека, которое могли дать в насмешку. Менее распространённая версия выводит основу из тюркских языков, где «флом» могло означать что-то вроде «пламя» или «огонь», но это сомнительно: в русской среде подобные заимствования редки и обычно имеют иную огласовку.

Встречаются варианты написания с одной «м» — Фомина, но это уже совсем другая фамилия, от имени Фома. Фломина с двумя «м» — более редкая и локальная. Географически она тяготеет к Поволжью и северо-западным областям, где диалектная лексика сохраняла подобные глагольные формы. В переписных книгах XVII века такие прозвища почти не фиксируются, что говорит о её позднем оформлении — скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда крестьянам массово присваивали фамилии по уличным прозвищам.

Таким образом, предки современных Фломиных — скорее всего, крестьяне из северных или центральных губерний, получившие фамилию по бытовому прозвищу. Никакого дворянского или духовного происхождения у этой фамилии нет, искать её в родословных книгах бесполезно — она из народной толщи.