Фамилия Флотская — женская форма фамилии Флотский. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев или -ин, эта образована по адъективной модели, то есть является полным прилагательным. Такие фамилии характерны для духовенства (Рождественский, Успенский) или для выходцев из южных и западных регионов России, Украины и Беларуси, где эта модель встречается чаще. Но в случае с Флотской/Флотским связь с церковью маловероятна: основа «флот» указывает прямо на морскую службу.

Скорее всего, фамилию давали в военно-морской среде. В России XVIII–XIX веков фамилии на -ский/-цкий нередко присваивали воспитанникам морских училищ и кадетских корпусов, а также детям, рождённым в семьях моряков. Могли назвать Флотским сына матроса или офицера, чтобы подчеркнуть принадлежность к морскому ведомству. Встречается и другой вариант: прозвище Флотский могли дать на суше человеку, который любил рассказывать о морских походах, носил одежду матросского покроя или просто жил у моря.

Мужской вариант — Флотский — встречается в документах с XIX века, особенно в приморских губерниях: Херсонской, Таврической, в Одессе и Севастополе. Женская форма Флотская, соответственно, фиксируется как фамилия жены или вдовы такого человека. В советское время фамилия могла быть дана искусственно, например, детям из детдомов, от которых не знали настоящей фамилии, но знали, что отец служил на флоте.

Поскольку фамилия редкая и не крестьянская по происхождению, её носители в большинстве своём — потомки людей, чья жизнь была связана с морем, либо получившие фамилию при переписи по роду занятий. Путать с «флотской» как с названием воинской части или формы одежды не стоит — это именно родовая фамилия, хоть и звучащая как прилагательное.