Фамилия Флюстов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного «ремесленного» или «географического» корня, как у Кузнецовых или Горских. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по модели образования.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую или прозвищную фамилию. Основа — Флюст. Скорее всего, это прозвище, а не крестильное имя. В русских говорах и диалектах слово «флюст» не имеет хождения, но зато есть в польском и украинском языках. В польском «flust» — это устаревшее название человека, который ходит по воде, плавает, то есть «моряк» или «пловец». В украинских говорах «флюст» могло означать «бродяга» или «шатун» — человека, который часто меняет место жительства.

Вероятнее всего, фамилия Флюстов имеет западное, возможно, польское или западнорусское происхождение. Её носитель мог быть выходцем из регионов, где смешивались русские, белорусские и польские диалекты — например, из Смоленщины, Брянщины или западных областей современной Украины. Прозвище Флюст дали либо человеку, связанному с водой (рыбаку, лодочнику), либо тому, кого считали «перекати-поле» — непоседливому, склонному к странствиям.

Другая, менее вероятная версия — от немецкого «Fluss» (река) или «flüssig» (текучий, жидкий). Но в этом случае фамилия скорее звучала бы как Флюссов или Флюсманн. Русское окончание -ов на немецкой основе — случай возможный, но редкий, и обычно такие фамилии появлялись у обрусевших немцев в Поволжье или Петербурге. Для Флюстова эта версия слабая: нет подтверждений массового бытования фамилии в немецких колониях.

Фамилия не относится к дворянским или старинным боярским родам. Её носители — скорее всего, крестьяне или мещане, получившие фамилию по прозвищу предка. Встречается она крайне редко, в основном на западе России и в Беларуси. Если вы носите фамилию Флюстов, ваши предки, вероятно, жили на границе с Польшей или в украинском Полесье, и их прозвище могло означать либо «водяного человека», либо «вечного странника».