Фамилия Фндотова — редкий случай, когда ошибка написания закрепилась в официальном родовом имени. Вероятнее всего, это искажённая форма фамилии Федотова, где в первом слоге произошла замена гласной «е» на «н» под влиянием диалектного произношения или ошибки писаря. В русских говорах, особенно северных и рязанских, «е» после мягких согласных могла звучать как нечто среднее между «и» и «е», что на письме иногда передавали буквой «н». Фамилия Федотова, в свою очередь, происходит от крестильного имени Федот (греч. Теодотос — «данный богами»), а суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Федота».

Если версия с опиской верна, то предки носительницы фамилии Фндотова были либо крестьянами, либо посадскими людьми — в среде грамотных дворян такие ошибки встречались реже. Интересно, что в метрических книгах XIX века можно найти единичные записи именно с таким написанием, что подтверждает: это не единичный сбой, а устойчивая фамильная форма. Альтернативная гипотеза — связь с прозвищем Фнда, но в русском языке такого корня нет, а в тюркских языках «фнда» не даёт осмысленного прозвища, поэтому версия с искажением остаётся основной.

Словообразовательно фамилия ничем не примечательна — стандартная патронимическая модель на -ов/-ев, женский вариант которой образуется добавлением -а. Однако сам факт, что ошибка не была исправлена и перешла по наследству, делает эту фамилию живым свидетельством работы старой канцелярии: писарь записал на слух, а потомки уже не перепроверяли. В современных базах данных фамилия Фндотова встречается крайне редко, в основном в Центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает её локальное происхождение.