Фамилия Фокшук — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. Её основа — топоним Фокшаны, старинный город на границе Румынии и Молдовы (ныне Румыния). В русской и украинской традиции названия городов часто становились прозвищами для выходцев оттуда: человек, перебравшийся из Фокшан, получал прозвище Фокшан, Фокша, а на юго-западе Российской империи, где были сильны молдавские и румынские влияния, — Фокшук.

Модель образования проста и прозрачна: суффикс -ук (-юк) в украинской, белорусской и польской ономастике — один из самых распространённых патронимических и локативных маркеров. Он указывал на принадлежность: «сын такого-то» или «родом оттуда-то». В случае с Фокшук — «выходец из Фокшан» или «сын Фокши». Первая версия вероятнее, потому что фамилия не имеет внутри себя личного имени (Фока в русских святцах есть, но дала бы форму Фокин или Фокович, а не Фокшук).

Написание фамилии закрепилось в кириллице как Фокшук, хотя в оригинале (рум. Focșanu) ударение падает на первый слог. В русскоязычной среде ударение часто смещается на последний слог по аналогии с типичными украинскими фамилиями на -ук. Вариант Фокшанский (с суффиксом -ский) тоже существует, но гораздо реже и указывает скорее на дворянское или шляхетское происхождение, тогда как Фокшук — фамилия крестьянская или мещанская.

Спорных версий у фамилии практически нет. Единственная альтернатива — от прозвища Фокша, которое могло быть образовано от диалектного глагола «фокшить» (в некоторых говорах — «пыхтеть», «сопеть»), но это натяжка: топонимическое происхождение лежит на поверхности и подтверждается ареалом фамилии. Встречается Фокшук преимущественно на западе Украины, в Молдове и среди молдавских диаспор, что идеально совпадает с историческими маршрутами миграции из Фокшан.