Фоминичев — фамилия с прозрачной этимологией, но с одной словообразовательной особенностью, которая выбивается из общего ряда. В её основе лежит крестильное имя Фома (от арамейского «близнец»). Однако если большинство «Фоминых» получили фамилию через притяжательное прилагательное (чей? — Фомин), то Фоминичев образован иначе: от отчества Фоминич (сын Фомы). Суффикс -ич в русской традиции указывал на прямое родство по отцу, а -ев добавился уже при оформлении фамилии по модели «чей сын?» — Фоминичев. Такая форма встречается реже, чем простой патроним на -ин, и говорит о том, что предок носителя фамилии звался не просто Фомой, а именно Фоминичем — то есть отчество закрепилось как родовое имя.

Вторая версия, менее распространённая, но не лишённая оснований: фамилия могла возникнуть от прозвища Фоминич, данного человеку, который служил у Фомы или был его младшим родственником (например, племянником). В этом случае суффикс -ич работал как уменьшительно-родственный, а не как отчество. Однако ономасты сходятся на том, что большинство фамилий на -ичев (Ильичев, Кузьмичев, Фоминичев) — это именно формы отчества, а не прозвища.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России: Вологодчина, Архангельская губерния, Нижегородский край. В документах XVII–XVIII веков Фоминичевы встречаются среди крестьян и посадских людей, реже — среди однодворцев. Дворянских родов с такой фамилией в «Общем гербовнике» нет, что указывает на её преимущественно простонародное происхождение.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Фоминичев стоит в одном ряду с Фомичевым и Фоминым, но отличается от них степенью патронимической детализации: Фомин — «чей-то сын», Фомичев — «сын Фомки» (с уничижительным суффиксом), Фоминичев — «сын Фоминича», то есть внук Фомы. Такая трёхступенчатая модель делала фамилию длиннее, но точнее указывала на родословную линию, что в крестьянской среде было важно для различения больших семей в одной деревне.