Фамилия Фоминиченко — характерный пример украинской фамилии, образованной по патронимической модели с помощью суффикса -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в украинской ономастике, изначально означал «маленький» или «сын»: Фоминиченко — буквально «сын Фоминича», то есть внук или потомок Фомы.

В основе фамилии лежит каноническое имя Фома (от арамейского «близнец»), которое в православной традиции носил один из апостолов. Украинская народная форма этого имени — Хома, но в фамилии, скорее всего, закрепился вариант с начальным «Ф», что указывает на книжное, церковное происхождение. Сама фамилия Фоминиченко — трёхступенчатая: от имени Фома образовано отчество Фоминич (Фоминич), а от него, с помощью уменьшительно-родового суффикса -енко, — уже фамилия потомка.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным регионам Украины, особенно к бывшим землям Гетманщины и Слобожанщины, где фамилии на -енко в XVII–XVIII веках стали массовыми. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев (Фомин), украинская модель подчёркивает не принадлежность отцу, а происхождение по мужской линии с оттенком «внук» или «младший из рода».

Интересная деталь: фамилия Фоминиченко могла возникнуть не только от имени, но и от прозвища Фома, если его дали человеку за какой-то характерный признак — например, за сходство с апостолом, известным своим недоверием, или просто за привычку сомневаться. Однако основная версия остаётся патронимической: предок Фоминиченко был либо сыном человека по имени Фома, либо, что вероятнее, внуком, чей отец уже носил отчество Фоминич.

В написании фамилии встречается путаница: наряду с Фоминиченко бытует вариант Фомениченко (с «е» во втором слоге), что отражает местные говоры, где безударное «и» могло редуцироваться. Оба варианта — однокоренные и означают одно и то же.