Фамилия Фоминцов имеет топонимическое происхождение и образована от прозвища Фоминец. Фоминцом могли называть выходца из деревни Фомино, расположенной в Смоленской области. Владелец этой деревни, предположительно, имел фамилию Фомин, в основе которой лежит имя Фома. В свою очередь, имя Фома происходит из греческого языка и означает «близнец». Одним из святых покровителей этого имени является один из двенадцати апостолов Фома. Поэтому выражение «Фома неверующий» стало нарицательным для недоверчивого слушателя. Это значение также, вероятно, могло лечь в основу фамилии Фоминцов. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Фоминец, со временем получил фамилию Фоминцов.