Фуфайкин — одна из тех фамилий, чья основа лежит на поверхности, но таит в себе неожиданный поворот. Самое очевидное, что приходит в голову, — связь с фуфайкой, тёплой стёганой курткой. Однако в русской ономастике прозвища по одежде давали не тому, кто её носил, а тому, кто её шил или продавал. Скорее всего, родоначальник Фуфайкиных был портным, специализировавшимся на ватных фуфайках, либо торговцем на ярмарке. Это прозвище по ремеслу — «Фуфайка» — и легло в основу фамилии через стандартный патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «сын Фуфайки».

Но есть и другая, более глубокая версия. Слово «фуфайка» — заимствование, пришедшее в русский язык из польского или через украинское посредство, где «фуфайка» означала «короткая кофта, безрукавка». В народной речи слово могло звучать как «хухляйка» или «хуфайка». Интересно, что в некоторых южнорусских и украинских говорах «фуфайкой» называли не одежду, а нечто иное — например, неуклюжего, неповоротливого человека или даже ленивца. В этом случае прозвище Фуфайка могло закрепиться за человеком с медлительным, флегматичным характером. Такая версия менее вероятна, чем ремесленная, но полностью исключать её нельзя: прозвища по внутренним качествам в крестьянской среде были не реже, чем по профессии.

В словообразовательном плане фамилия Фуфайкин типична для северных и центральных областей России, где суффикс -ин активно конкурировал с -ов. Она стоит в одном ряду с фамилиями вроде Телегин, Шубин, Тулупов — все они образованы от названий предметов быта или одежды. С точки зрения географии, фамилия не относится к массовым, но встречается в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях — именно там портные-скорняки, работавшие с овчиной и ватой, были особенно востребованы.

Если опираться на словарь Б. Унбегауна «Русские фамилии», то модель «основа нарицательного существительного + ин» — одна из древнейших, и Фуфайкин вписывается в неё идеально. Никаких дворянских корней или боярских родов за этой фамилией не числится: это стопроцентно крестьянская или мещанская фамилия, и её носители, скорее всего, были людьми мастеровыми, а не землепашцами.