Основой фамилии Фугин послужило мирское имя Фуга. Мирское имя Фуга восходит к украинскому «фуга», что значит «вьюга», «метель». Скорее всего, такое имя получил ребёнок, родившийся в непогоду. Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Фугин образована от прозвища, которое связано с заимствованным из немецкого языка словом «фуга» - плотный продольный стык двух досок. В этом случае прозвище Фуга мог получить столяр. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Фуга, со временем получил фамилию Фугин.