Фамилия Фуниковы напрямую связана с именем Афанасий, и это не ошибка: в основе лежит его просторечная форма Фуник. Полное церковное имя Афанасий происходит от греческого слова «афанасия» — бессмертие. В старину, особенно среди простых людей, полные имена часто сокращали и переделывали на свой лад, так и появился Фуник. От этого прозвища-имени и пошла фамилия, отвечающая на вопрос «чей ты будешь?» — Фуников, то есть сын или потомок Фуника.

Стоит отметить, что модель образования через суффикс -ов — одна из самых распространенных в русской ономастике, что делает фамилию типичной для своего времени, хотя само имя-основа встречается нечасто. Покровителем имени считается преподобный Афанасий Печерский, живший в Киево-Печерском монастыре. Его история примечательна: после тяжелой болезни он скончался, и братия приготовила его к погребению, но на третий день, перед самыми похоронами, он ожил и обратился к ним с духовным назиданием. После этого чуда Афанасий затворился в пещере на долгие годы, не видя солнца, питаясь лишь хлебом и водой и непрестанно плача. Он молчал все это время и только перед самой кончиной снова призвал братию, призывая их к послушанию, покаянию и молитве, сказав: «Блажен, кто здесь сподобится положенным быть». Его мощи, сохранившиеся нетленными, покоятся в Антониевой пещере, и у них случалось много исцелений.

Исторические документы подтверждают древность рода. В труде С. Б. Веселовского упоминаются заметные фигуры: князь Афанасий Давидович Фуник Кемский, а также Афанасий Иванович Фуник Курцев, дьяк в 1531 году. Особого внимания заслуживает его сын Никита Фуников, служивший казначеем царя Ивана Грозного и казненный в годы опричнины — яркий пример того, как высоко поднимались и как трагически падали люди того времени. Встречаются в источниках и другие носители прозвища: Фуник Васильевич Курчев-Пушкин в середине XVI века и Андрей Петрович Фуник Солнцев.

Таким образом, потомок человека по имени Фуник со временем получил фамилию Фуников. Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно, ведь процесс формирования русских фамилий растянулся на столетия. Однако очевидно, что перед нами не случайное сочетание букв, а памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе память о крестильном имени и живых людях, которые носили его пять веков назад.