Фамилия Габдикова — женская форма фамилии Габдиков, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы на согласный с помощью суффикса -ов. Вопрос в том, что за основа скрывается за этим «Габдик». Здесь возможны два пути, и оба ведут в тюркский мир.

Наиболее вероятная версия — происхождение от личного имени Габдик, которое является краткой, бытовой формой от арабского имени Абдулла (или его варианта Абдул). В тюркской среде, особенно у татар и башкир, имя Абдулла («раб Аллаха») часто редуцировалось до форм вроде Габдулла, Габди, а затем и Габдик. Уменьшительный суффикс -ик (или -ек) придавал имени ласкательный или обиходный оттенок. Таким образом, Габдик — это «маленький Абдулла» или просто «Абдулла» в домашнем кругу. От этого прозвища-имени и пошла фамилия: «чей?» — Габдиков, то есть потомок человека по имени Габдик.

Вторая, менее распространённая гипотеза, связывает основу с тюркским словом «габди» (или «габид») — «раб», «покорный слуга». В этом случае прозвище Габдик могло указывать не на имя, а на смирение или социальное положение предка. Однако, учитывая, что в ономастике фамилии от имён встречаются чаще, чем от нарицательных прозвищ, версия с именем Абдулла выглядит убедительнее.

Фамилия Габдикова — не массовая, её географическое распространение, скорее всего, привязано к регионам традиционного проживания татар и башкир (Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области). Встречается она и среди казахов, где имя Габдик также бытовало. С точки зрения сословной истории, предки носителей этой фамилии могли быть как крестьянами, так и представителями духовенства (муллами или их учениками), поскольку имя Абдулла часто давали в религиозных семьях. Написание фамилии — с буквой «Г» в начале — указывает на адаптацию арабского звука через тюркское посредство, что типично для волго-уральского региона.