Фамилия Габдюшева — яркий пример того, как русская словообразовательная модель наложилась на имя тюркского происхождения. Основа здесь — мужское личное имя Габдюш, которое, в свою очередь, является диалектной или обиходной формой от арабского имени Абдуллах (в тюркской передаче — Абдулла, Габдулла). Имя означает «раб Божий» или «слуга Аллаха»: «абд» — раб, «Аллах» — Бог. Усечение и замена начального «А» на «Г» (характерное для татарского и башкирского языков) дали форму Габдюш, а уменьшительно-ласкательный суффикс -юш закрепил её в быту.

Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Габдюш добавили суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Габдюшев). Женская форма Габдюшева — это, соответственно, вариант для замужней женщины или дочери. Такой способ образования фамилий от тюркских имён был массовым в XVI–XIX веках, когда народы Поволжья и Приуралья активно контактировали с русским населением, а затем и входили в состав Российской империи.

Географически фамилия тяготеет к регионам с преобладанием татарского и башкирского населения: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Самарская области. Встречается она и у русских, но в таких случаях, скорее всего, указывает на смешанные браки или давнюю ассимиляцию. Отсутствие в фамилии типично русского суффикса -ин (который часто присоединялся к именам на -а, -я) — косвенное подтверждение, что имя Габдюш воспринималось как основа на согласный, а не как «женское» окончание.

Родственные фамилии того же корня — Габдуллин, Габдушев, Абдуллин, Абдюшев. Разница в суффиксах и начальной букве отражает местные диалектные особенности: где-то предпочитали форму с «А», где-то с «Г», где-то добавляли русский суффикс, а где-то оставляли тюркский -ин (от арабского «ибн» — сын). Носитель фамилии Габдюшева может с высокой вероятностью проследить свои корни до человека, которого в документах XVII–XVIII веков записали просто как Габдюш — вероятно, крестьянина, ремесленника или служилого татарина, носившего имя, данное по религиозной традиции.