Фамилия Гамус — редкий случай, когда основа не даёт однозначного ответа, а заставляет выбирать между географией и прозвищем. В русских фамилиях суффикс -ус встречается нечасто и почти всегда указывает на латинское или польское посредничество. Если фамилия исконно русская, то перед нами, скорее всего, результат переоформления прозвища в семинарской среде: будущих священников нередко «латинизировали», заменяя окончание на -ус. Исходным могло быть слово «гам» — в южнорусских говорах так называли шум, гам, крикливую ссору. Прозвище Гам дали бы горлану или задире, а в духовном училище его превратили в Гамуса, придав фамилии учёный вид.

Однако есть и другая, более прямая версия. В украинском и польском языках «гамус» (hamus) — заимствование из немецкого Hammel, то есть «баран», «валух». В этом случае фамилия могла быть профессиональным прозвищем овцевода или мясника, а на восточнославянской почве закрепилась без изменений. Подтверждением служит то, что фамилия Гамус встречается в западных областях Украины и в Польше, а в России — единичными вкраплениями, часто в среде потомков переселенцев из тех краёв.

Третья, менее вероятная гипотеза выводит фамилию из греческого «гамос» — «брак». В этом случае Гамусом могли окрестить незаконнорождённого или, наоборот, свадебного распорядителя. Но греческая версия слаба: в русской ономастике такие прямые заимствования из греческого быта без церковного контекста — редкость, а для семинарской фамилии скорее взяли бы латинское matrimonium.

Таким образом, фамилия Гамус с наибольшей вероятностью либо семинарская переделка прозвища Гам, либо западнорусское прозвище скотовода. В обоих случаях носитель фамилии — потомок человека, которого отличал либо громкий голос, либо занятие овцеводством.