Фамилия Ганапольская — одна из тех, что указывает на конкретное географическое происхождение предка. В основе фамилии лежит прозвище Ганапольский, образованное от названия населённого пункта Аннополь. Это местечко в Острожском уезде Волынской губернии (историческая территория современной Украины) в 1761 году получило привилегию от польского короля Августа III. До этого поселение называлось Глинники, но, перейдя во владение князей Яблоновских, было переименовано в честь княгини Анны Яблоновской. Князь Антон Яблоновский построил здесь замок и разбил парк, а его сын основал униатскую церковь.

В 1821 году после пожара Острожского монастыря епископ Волынский Стефан Романовский сделал Аннополь своей резиденцией и перенёс сюда духовную православную семинарию. А в 1820 году в местечке прошёл смотр Литовского корпуса в присутствии великого князя Константина Павловича. Очевидно, что основатель рода Ганапольских был выходцем именно из этого местечка.

Фамилия сохранила в своём написании характерную для польской традиции передачу топонимов: начальное «а» превратилось в «га» (ср. Ганнополь, Ганаполь). Модель образования — стандартная для фамилий на -ский/-цкий, указывающих на дворянское или шляхетское происхождение, однако в данном случае фамилия бытовала и среди еврейского населения. Архивные документы подтверждают это: в Книге памяти Республики Коми записан еврей Ганапольский Вульф Григорьевич, родившийся в 1907 году на Украине, в селе Андрусевка Херсонской области.

Среди известных носителей фамилии — Матвей Юрьевич Ганапольский, российский журналист, театральный режиссёр и общественный деятель, член президиума Российского еврейского конгресса. Таким образом, фамилия Ганапольская, несмотря на кажущуюся редкость, имеет ясную географическую привязку и уходит корнями в историю Волынского края XVIII века.