Фамилия Ганифанидов — нечастая, но устроена на удивление прозрачно. Сразу видно: перед нами классическая модель «русская фамилия из тюркского имени». Основа — мужское имя Ганифан, которое в русской среде звучало как вариант тюркского Гани (от арабского Гани — «богатый», «состоятельный») с добавлением форманта -фан. Этот -фан мог возникнуть под влиянием имён вроде Абдулфанах или просто как диалектное переоформление, характерное для татарской, башкирской или ногайской ономастики. Суффикс -ов, а в данном случае -идов, указывает на отчество: Ганифанидов значит «сын Ганифана». Двойной суффикс -идов — редкая деталь. Обычно фамилии на -ов образуются прямо от имени (Ганифанов), но здесь мы видим форму Ганифанидов, где -ид- выступает как дополнительный патронимический элемент, наподобие греческого -идис или тюркского -улы/-оглы, но вписанный в русскую модель. Это говорит о том, что фамилия могла сложиться в среде, где сохранялась память о двух поколениях предков: деда звали Ганифан, а отца — Ганифанид (то есть «сын Ганифана»), и уже от этого отчества пошла фамилия. Географически такие формы встречаются среди поволжских татар и башкир, а также у кавказских народов, испытавших тюркское влияние. В русских документах XVIII–XIX веков подобные фамилии фиксировались у крещёных татар и служилых мурз, переходивших в православие. Носитель фамилии Ганифанидов, скорее всего, потомок человека, которого в миру или по документам звали Ганифан — имя нецерковное, но после крещения его могли дать в честь крёстного или просто по семейной традиции. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и купцами или мелкопоместными дворянами — точных данных по этой конкретной фамилии нет, но модель указывает на среду, где имя сохраняло тюркский корень, а фамилия оформлялась по русскому образцу.