Фамилия Ганобин — нечастая, и её происхождение не лежит на поверхности. Сразу заметна модель образования: суффикс -ин указывает на то, что в основе лежит прозвище или имя, оканчивающееся на -а (Ганоба). Такая модель типична для русских фамилий, но вот с корнем всё интереснее.

Самая распространённая версия связывает прозвище Ганоба с украинским словом ганьба — «осуждение, позор». Если так, то прозвище могли дать человеку, чей образ жизни или поступки расходились с мнением окружающих. Не обязательно речь о чём-то предосудительном: часто односельчане «осуждали» того, кто выделялся — например, нелюдимого или слишком самостоятельного человека.

Есть и вторая, менее очевидная гипотеза, которую стоит рассмотреть всерьёз. Она выводит Ганобу из балтийских языков, конкретно из литовского ganyba — «пастьба, выпас». В этом случае прозвище было профессиональным: Ганобой называли пастуха. Версия правдоподобна, если учесть, что в пограничных с Литвой русских землях (Смоленщина, Брянщина) литовские заимствования в прозвищах не редкость. Выбрать одну из двух версий сложно — обе имеют логику, но лингвистически балтийский корень даёт более конкретную и устойчивую привязку к занятию предка.

Фамилия Ганобин — редкий пример, когда даже корень остаётся предметом спора. Но именно это и делает её интересной: за ней может стоять либо пастух из литовских окраин, либо человек, которого в своём селе считали «не таким».