Фамилия Ганобин образована от прозвища Ганоба. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «гана, ганьба» (в переводе с украинского – «осуждение»). Возможно, предок обладателя этой фамилии вел образ жизни, в чем-то отличный от общепринятого, за что его и осуждали односельчане. Согласно другой гипотезе, фамилия Ганобин имеет балтийские корни и восходит к литовскому слову ganyba - «пастьба». В таком случае прозвище Ганоба относилось к числу «профессиональных» именований и указывало на род занятий человека. Так, Ганобой могли называть пастуха. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ганоба, со временем получил фамилию Ганобин.