Фамилия Ганузек звучит необычно для русского уха, но это не случайность. Скорее всего, она имеет польское или западноукраинское происхождение. В её основе лежит прозвище Ганузя, которое является уменьшительно-ласкательной формой от имени Ганусь, а то, в свою очередь, — народный вариант имени Иоанн (Ян, Иван). Уменьшительный суффикс -ек в конце фамилии характерен для польской и южнорусской ономастики: в польском языке он часто субстантивируется, превращая прозвище в фамилию. Таким образом, Ганузек — это «сын Ганузи» или «маленький Ганузя».

Вторая версия, менее вероятная, но возможная, связывает фамилию с диалектным словом «гануз» или «гануза». В некоторых говорах так могли называть человека нерасторопного, медлительного или, наоборот, упрямого. Однако отсутствие широкой фиксации такого слова в словарях делает эту гипотезу слабой. Гораздо логичнее исходить из антропонимической модели: в польской традиции фамилии на -ек от крестильных имён — явление массовое (сравните: Янушек, Войтусек, Павелек).

С точки зрения географии, фамилия Ганузек встречается в основном на западе Украины (Волынь, Галиция) и в Польше. В России она редкая и, вероятно, появилась в результате миграций конца XIX — начала XX века. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Сословная принадлежность здесь не прослеживается: фамилии на -ек в Польше носили все слои населения, от шляхты до крестьян, но в Российской империи носители польских фамилий часто оказывались в мещанском или крестьянском сословии.

В написании фамилии стоит обратить внимание на твёрдый звук [з] в середине: Ганузек, а не Ганусек. Это указывает на то, что в исходном прозвище был именно «з», а не «с». Если бы основа была от Гануся (с мягким «с»), фамилия звучала бы как Ганусек. Твёрдость согласного — ещё один намёк на возможное влияние украинской фонетики, где подобное отвердение встречается чаще, чем в литературном польском.