Фамилия Ганзецкая — женская форма, мужской вариант — Ганзецкий. Это типичная фамилия польского или западнорусского происхождения, образованная по модели с суффиксом -цк-/-ск-. Такие фамилии указывали на географическую привязку: их давали по названию населённого пункта, поместья или местности. В основе лежит топоним Ганзец (Ganiec, Ganiec) или Ганьск (Gańsk). Скорее всего, предок носителя фамилии владел землёй или жил в местечке с таким названием — в Польше или на территории бывшей Речи Посполитой (современные Беларусь, Украина, Литва). Следы таких топонимов встречаются, например, в Мазовии и на Подляшье.

Корень «Ганз-» может восходить к древнепольскому слову ganić — «хулить, бранить, порицать». В таком случае прозвище Ганзец могли дать человеку сварливому, склонному к критике, или, наоборот, тому, кого часто ругали. Но это лишь одна из версий. Возможна и связь с немецким именем Ганс (Hans) — через диалектное «Ганз»: в Польше и Западной Руси немецкие имена нередко адаптировались, давая начало прозвищам и фамилиям. Однако для фамилии с суффиксальным оформлением -цк-/-ск- топонимическая версия выглядит надёжнее.

В Российской империи фамилии на -ский/-цкий были распространены среди шляхты и духовенства, но встречались и у крестьян, получивших фамилию по месту рождения. Ганзецкие могли быть мелкопоместными дворянами, например, герба Наленч или Ястршембец, но точных подтверждений этому нет. Встречается фамилия и среди православных, и среди католиков — граница вероисповеданий в этих краях была подвижной.

Сегодня фамилия редкая. Её носители живут в основном в Польше, Беларуси, а также в России и на Украине — в областях, исторически связанных с западнорусскими землями. Написание через «е» (Ганзецкая) — результат адаптации польского Ganiecka или Ganiecka к русской орфографии. Если бы фамилия была чисто русской, она звучала бы как Ганзецкова или Ганзецкина, но суффикс -цк- выдает её западное происхождение.