Фамилия Гатаучюте звучит для русского уха необычно, и это не случайно: она не русская по происхождению, а литовская. Её носительница — почти наверняка женщина. Ключ к пониманию фамилии — в её окончании «-юте». В литовском языке это один из суффиксов, образующих женские фамилии от мужских. Если бы фамилия принадлежала мужчине, она звучала бы как Гатаучюс. Таким образом, Гатаучюте — это «дочь» или «жена» Гатаучюса.

Основа фамилии — «Гатауч» — восходит к литовскому слову gatauti или gauti, что означает «получать», «добывать», «доставать». В более широком смысле — «тот, кто умеет добывать, промышлять». Скорее всего, прозвище Гатаучюс дали человеку запасливому, удачливому в делах или умеющему раздобыть необходимое. Это не ремесленная фамилия (как, например, Кузнецов), а скорее прозвищная, характеризующая личные качества или жизненную хватку предка.

Литовские фамилии на «-юс» и производные от них женские формы на «-юте» массово закрепились в XIX веке, когда шло оформление литовской антропонимики. В Российской империи, куда входила Литва, такие фамилии часто русифицировали, меняя окончания, но Гатаучюте сохранила свою национальную форму. Это указывает на то, что род, вероятно, не покидал пределов исторической Литвы (современная Литва, запад Беларуси или часть Польши) и не подвергся сильной ассимиляции.

Встретить фамилию Гатаучюте сегодня можно преимущественно в Литве, а также среди литовской диаспоры. В русскоязычных источниках она редка, поэтому её обладательница почти со стопроцентной уверенностью может говорить о своих литовских корнях. Других версий происхождения, например от тюркских или славянских корней, нет — словообразовательная модель однозначно указывает на балтскую природу фамилии.