Фамилия Гайдоров — одна из тех, где внешняя простота обманчива. На первый взгляд она кажется отчеством от имени или прозвища Гайдор, но корень здесь неочевиден и вызывает споры у ономастов.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом «гайдар» (или «хайдар»), что в переводе означает «лев» или «могучий». Это имя было распространено у народов, исповедующих ислам, и могло попасть в русскую среду через татар, башкир или казахов. В таком случае Гайдоров — это русифицированная форма отчества: сын Гайдара. Суффикс -ов указывает на принадлежность, характерную для русских фамилий, образованных от восточных имен. Подтверждением служит и то, что фамилия чаще встречается в регионах Поволжья и Приуралья, где исторически было сильное тюркское влияние.

Вторая, менее популярная гипотеза, выводит фамилию от прозвища Гайдар, которое на южных говорах могло означать «пастух» или «табунщик» (от украинского «гай» — лес, роща, но связь с пастушеством здесь косвенная). Однако эта версия слабее: слово «гайдар» в значении «пастух» не зафиксировано в авторитетных словарях русских говоров как распространенное, а вот тюркское имя Гайдар хорошо известно, в том числе по знаменитому писателю Аркадию Гайдару (настоящая фамилия Голиков, а псевдоним он взял именно от тюркского имени).

Таким образом, предок современного Гайдорова с высокой долей вероятности носил имя Гайдар. Он мог быть татарином, башкиром или казахом, перешедшим в православие, либо русским, получившим такое прозвище за силу и стать — по аналогии со львом. Сословная принадлежность могла быть любой: от крестьянина до служилого человека. Фамилия не относится к числу древних дворянских, но и не редкая — ее носители рассеяны по всей России, с заметным сгущением в Оренбургской, Челябинской областях и Башкортостане.