Фамилия Гайгаров — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного тюркского или финно-угорского корня, который напрашивается по звучанию. Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от прозвища, связанного с диалектным словом.

Наиболее вероятная версия отсылает к русским говорам. В архангельских и вологодских диалектах «гайгара» — это морская птица, разновидность гагары. Прозвище Гайгара могли дать человеку за длинную шею, характерный крик или манеру поведения, либо за профессию — охотника на морскую птицу. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: «чей?» — Гайгаров, то есть сын или потомок Гайгары.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с кавказскими языками. В осетинском или ингушском есть слово «гайг» (или «гаг»), означающее «горный козёл» или «серна». Прозвище Гайгар могло закрепиться за ловким, быстрым пастухом или охотником. Однако в таком случае фамилия должна была бы писаться через «а» на конце основы (Гайгаров или Гайгаров), а суффикс -ов в этом регионе встречается реже, чем -ты или -ев. Поэтому первая версия выглядит убедительнее.

Фамилия практически не встречается в центральных областях России, её очаги — Русский Север (Архангельская, Мурманская области) и, возможно, отдельные поселения в Поволжье, куда переселились поморы. Сословно носители фамилии — скорее всего, государственные крестьяне или мещане, реже — казаки. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в ряду с такими же «птичьими» прозвищами: Гагаров, Гагарин, Гоголев, Чайкин. Но если Гагарин стал знаменит на весь мир, то Гайгаров остался локальным, почти не выходя за пределы северных говоров. Это делает фамилию ценным маркером региональной идентичности.