Фамилия Гёдакян — почти наверняка армянская. Её выдают два маркера: конечное -ян (патронимический суффикс, указывающий на принадлежность к роду) и начальное Гё-, которое в русской передаче часто отражает армянское յё (йо) или գյո (гю). В самой Армении фамилию могли бы записать как Գյոդակյան (Gyodakyan) или Գյոդաքյան, в зависимости от диалекта.

Основа Гёдак — это либо прозвище, либо название ремесла, либо искажённое топонимическое имя. Самый прямой путь: армянское слово «гёдак» (գյոդակ) может означать «маленький», «недоросль» или «коротышка». В диалектах Западной Армении (особенно в зоне Вана и Муша) это слово бытовало как прозвище для невысокого человека или младшего сына. Соответственно, Гёдакян — «из рода маленького» или «потомок Коротышки». Версия не универсальная, но лингвистически прозрачная.

Вторая возможность — профессиональная. В турецком и заимствованных армянских говорах «гёдак» могло быть вариантом слова «гёдек» (gödek) — «мастерок», «штукатурная лопатка». Если так, предок Гёдакян был каменщиком или штукатуром. Но эта гипотеза слабее: слово «гёдек» в значении инструмента фиксируется реже, и переход от названия орудия к фамилии менее типичен для армянской антропонимии, чем прозвище по внешности.

Третья версия — топонимическая. В исторической Западной Армении (ныне восток Турции) существовали сёла с корнем Гёд- или Гёдак- (например, Гёдекли в вилайете Эрзурум). Фамилия могла закрепиться за выходцами из такого места, но без конкретного указания на село в источниках это лишь догадка.

Сословный состав армянских фамилий на -ян в целом демократичен: их носили и крестьяне, и ремесленники, и священники. Гёдакян — не княжеская фамилия (те обычно оканчиваются на -уни или -янц), а рядовая, скорее всего сельская. Массовый исход армян из Османской империи в конце XIX — начале XX века мог привести носителей фамилии на Кубань, в Ростовскую область или в Закавказье, где фамилия встречается и сегодня, хотя и нечастотно.

В написании через «ё» есть нюанс. В паспортах и документах буква «ё» часто факультативна, поэтому Гёдакян могут записывать как Гедакян, теряя произносительную разницу. В самой Армении фамилию пишут через «е» (Едакян) или «ё» в зависимости от диалекта произношения. Учитывая редкость фамилии, каждая ветвь рода хранит свою версию происхождения — и, возможно, правы все, кто помнит устное предание о прозвище предка.