Фамилия Гедоян — типичный пример армянской фамилии, образованной по модели, распространённой в Закавказье. Основа здесь — личное имя или прозвище Гедой, а суффикс -ян указывает на принадлежность к роду: «из дома Гедоя», «потомок Гедоя». Это аналог русских фамилий на -ов/-ев, только в армянской традиции притяжательное значение передаётся через окончание -ян (реже -янц).

Корень «Гед-» в армянском языке может восходить к слову «гет» или «гед» — река, поток. В таком случае Гедой — это человек, живший у реки, или тот, кого прозвали «речным». Версия не самая частая, но лингвистически возможная: в армянской ономастике встречаются фамилии, образованные от гидронимов (например, Аракелян — от названия реки Аракс). Однако чаще всего подобные фамилии ведут начало от уменьшительных форм имён. Имя Гедой могло быть краткой формой от Геворг (Георгий) или от Гедик — армянского варианта имени, связанного со значением «маленький», «младший».

Географически фамилия Гедоян наиболее характерна для западных областей исторической Армении — районов Вана, Эрзурума, а также для армянской диаспоры, переселившейся в XIX веке на Кубань и в Ростовскую область. В России носители фамилии встречаются в Краснодарском крае, Ставрополье и в Москве. В отличие от фамилий на -ов, которые в армянской среде часто русифицировали (Гедоян → Гедоев), вариант Гедоян сохранил исконное окончание, что говорит о сравнительно поздней фиксации фамилии в документах — уже после того, как армянская письменная традиция закрепила суффикс -ян как стандартный.