Фамилия Гедзуни — редкая и неочевидная для русского уха. Начнем с суффикса: -уни в русских фамилиях почти не встречается. Такое окончание характерно для фамилий западного, в первую очередь польского или белорусского, происхождения, где суффикс -унь (как в фамилии Гедзунь) мог указывать на прозвище или профессию. В русской адаптации мягкий знак исчез, и появилось окончание -и, типичное для притяжательных форм вроде «чей?» — Гедзуни. То есть фамилия могла означать «сын или потомок Гедзуня».

Основа «гедз-» — почти наверняка диалектная. В белорусском и польском языках слово «giedz» или «giedź» означает «овод», «слепень». Прозвище Гедзь (или Гедзунь) могли дать человеку назойливому, надоедливому, либо, наоборот, быстрому и резкому, как овод. Есть и менее вероятная версия: от литовского «gedas» — «скорбь» или «жалость», но в контексте восточнославянской ономастики первая гипотеза правдоподобнее.

Географически фамилия Гедзуни тяготеет к западным регионам бывшей Речи Посполитой — современной Беларуси, восточной Польше, Литве. В России она встречается редко, обычно у потомков переселенцев. По социальному происхождению носители могли быть крестьянами или мещанами — фамилии на -унь часто давали простым людям, без дворянского статуса.

С точки зрения словообразования, Гедзуни — это не типичная русская фамилия с суффиксом -ов/-ев, а скорее архаичная форма родительного падежа множественного числа или притяжательного прилагательного. В документах XIX века подобные фамилии могли записывать как «Гедзунь» или «Гедзюнь», а окончание -и закрепилось при русификации.