Фамилия Гелентчер — редкий случай, когда основа слова не имеет славянских корней, а сам носитель фамилии почти наверняка происходит из среды, связанной с морем или речным делом. В основе лежит немецкое слово «Gelenk» (сустав, шарнир) или, что более вероятно, голландское «gelend» (гибкий, подвижный). В русском языке эта лексема закрепилась в виде «геленок» или «гелент» — так в некоторых говорах называли шарнирное соединение, часть такелажа или деталь корабельной оснастки. Суффикс «-ер» в немецком и голландском языках указывает на деятеля: Gelentscher — это мастер, который делал или ремонтировал шарниры, либо человек, работавший с подвижными механизмами на судне.

На русскую почву фамилия попала, скорее всего, через обрусевших иностранцев — мастеровых, приглашённых при Петре I и позже для строительства флота и портовой инфраструктуры. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии нередко записывали на слух, с искажениями, поэтому «Гелентчер» могло возникнуть из «Геленчер» или «Гелентшер». Окончание «-ер» при этом не получило типичного русского суффикса «-ов» или «-ин», что подтверждает иностранное происхождение: фамилия застыла в той форме, в которой её зафиксировали при переселении.

Версия, что фамилия происходит от названия города Геленджик, не выдерживает критики: топоним «Геленджик» имеет тюркские корни (от «геленджик» — маленькая невеста), и никакой словообразовательной связи с «чер» в фамилии нет. Также маловероятно, что это форма от «геленок» (детёныш животного) — такое прозвище дали бы скорее с суффиксом «-ов».

С географической точки зрения, носители фамилии Гелентчер встречаются в основном в южных регионах России и на Украине, что косвенно подтверждает связь с черноморскими портами. Сословно это, скорее всего, мещане или цеховые ремесленники, а не дворяне. Никаких известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что типично для узкопрофессиональных прозвищ, не перешедших в массовые. Таким образом, предок нынешних Гелентчеров был, вероятно, корабельным мастером по металлу или такелажником — человеком, чьи руки знали, как соединить детали в подвижный узел.