Фамилия Генеза — редкий случай в русском ономастиконе. Её не встретишь среди типичных «крестьянских» фамилий на -ов или -ин. Судя по всему, перед нами искусственное или семинарское образование, а не уличное прозвище.

Сам корень «генез-» отсылает к греческому genesis — «происхождение, возникновение». В русской церковной и академической среде XVIII–XIX веков это слово было на слуху: «Книга Бытия» по-гречески звучит как «Генезис». Фамилию могли дать выпускнику духовной семинарии, который хорошо знал древние языки или особо отличился на экзамене по Священному Писанию. Такие «говорящие» фамилии присваивали ученикам прямо в стенах училища, и они нередко вытесняли прежнюю родовую фамилию.

Окончание -а указывает на женскую форму, но в русской традиции фамилия Генеза склоняется как существительное мужского рода (он — Генеза, она — Генеза). По происхождению это не польская и не украинская модель, а скорее латинизированная или грецизированная огласовка, что тоже характерно для семинарской среды: студентам давали фамилии, звучащие торжественно и книжно.

Не исключена и менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть как русифицированная форма итальянской или испанской фамилии (например, Genesa), но без документальных подтверждений эта гипотеза остаётся слабой. Основной ареал бытования фамилии — юг России и центральные области, где было много духовных учебных заведений.

В отличие от фамилий, образованных от имени отца или ремесла, Генеза несёт в себе отвлечённое понятие. Её носитель — потомок человека, которого в своё время назвали по книжному слову, а не по двору или профессии. Это ставит фамилию в один ряд с такими семинарскими «диковинками», как Сперанский (от лат. spero — надеюсь) или Розов (от лат. rosa — роза).