Фамилия Гепоян — почти стопроцентный маркер армянского происхождения. Её выдает типичный армянский патронимический суффикс -ян, который восходит к древнему -янц и означает «из рода такого-то» или «принадлежащий». В русской среде такие фамилии часто русифицировались, теряя конечное -ц, но сохраняя основу. Так что Гепоян — это «из рода Гепо».

Сам корень «Гепо» — неочевидный. В армянском языке нет распространенного слова с таким звучанием, которое напрямую обозначало бы профессию или качество. Скорее всего, это сокращенная или видоизмененная форма личного имени. В качестве гипотезы можно предположить связь с именем Геворг (армянский вариант Георгия) — через диалектное стяжение Гев → Гепо. Либо в основе лежит прозвище, образованное от армянского «геп» (գեպ) — в некоторых говорах так могли называть горбатого или сутулого человека. Вторая версия менее вероятна, но полностью исключать её нельзя: прозвища по внешним признакам в основе армянских фамилий встречаются.

География фамилии Гепоян неширокая. Основные носители — выходцы из исторической Западной Армении (территория современной восточной Турции) и их потомки, расселившиеся после геноцида 1915 года. В России и странах бывшего СССР фамилия встречается редко, в основном в Краснодарском крае, Ростовской области и Армении. При переезде в русскоязычную среду ударение часто смещалось на последний слог — Гепоя́н, хотя по армянским правилам логичнее Гепо́ян (с ударением на корень).

О сословной принадлежности предков сказать почти нечего: армянские фамилии на -ян не дают подсказки о знатности или крестьянском происхождении — этот суффикс универсален для всех слоев. Единственное, что можно утверждать с уверенностью: фамилия сформировалась не раньше XVII–XVIII веков, когда у армян массово закреплялись наследственные родовые имена вместо отчеств.