По одной из версий, оно восходит к верхненемецкому существительному hopfener - «пивовар». Очевидно, прозвище Геппенер, которое легло в основу фамилии, относилось к профессиональным именованиям и указывало на род деятельности человека. Согласно другой гипотезе, Геппенером (нем. Göpner) прозвали выходца из города Гобен (Goben) в Баварии. В таком случае фамилия Геппенер указывает на место жительства предка. Наконец, нельзя исключить, что в основе этой фамилии лежит глагол happen - «хватать (что-л. зубами, ртом)». Следовательно, Геппенером могли называть хваткого человека.