Фамилия Гепнер — потомок немецких корней, и её происхождение связано либо с ремеслом, либо с географией. Первая и самая распространённая версия выводит фамилию из немецкого слова Hafner, то есть «горшечник» или «гончар». В этом случае прозвище Гефнер (а со временем и Гепнер) относилось к профессиональным именованиям: предок носителя фамилии, скорее всего, занимался изготовлением глиняной посуды. Такие прозвища были естественны в среде немецких ремесленников, которые часто селились целыми общинами в Российской империи, особенно в Поволжье и на юге страны.

Вторая гипотеза связывает фамилию с топонимом. Согласно ей, Гепнером (от нем. Göpner) называли выходца из баварского города Гобен (Goben). Такие «топонимические» фамилии давали переселенцам, чтобы отличать их по месту прежнего жительства. Обе версии имеют право на существование, но первая — профессиональная — встречается в ономастических источниках чаще, так как прозвища по роду занятий были более массовыми.

Обратите внимание на суффикс -ер, типичный для немецких фамилий, образованных от названий профессий (сравните: Bäcker — пекарь, Fischer — рыбак). Модель «основа (ремесло или место) + -ер» — одна из самых продуктивных в немецкой антропонимике. Фамилия Гепнер, таким образом, встраивается в этот ряд, и её носитель в прошлом почти наверняка был либо гончаром, либо человеком, перебравшимся из баварского Гобена.