Фамилия Гербалинская — одна из тех, чья основа сразу бросается в глаза, но точное происхождение остаётся неочевидным. Ключевой элемент здесь — корень «герб-», который напрямую отсылает к геральдике, гербу. Однако прямой связи с дворянским гербом у большинства носителей, скорее всего, не было. Слово «герб» в русском языке — заимствование из польского (herb), и в польской ономастике фамилии с этим корнем встречаются чаще. Гербалинская — типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «-ин- + -ск-», то есть от названия населённого пункта вроде Гербалино или Гербалин. Такие топонимы могли возникнуть от прозвища владельца усадьбы или первопоселенца — «Гербал», что означало человека, имевшего отношение к гербу: либо составителя гербов, либо того, кто гордился своим родовым знаком.

Суффикс «-ск-» указывает, что фамилия сформировалась в среде польской или западнорусской шляхты (дворянства), а также в среде духовенства, которое нередко получало «красивые» семинарские фамилии от латинских и польских корней. Окончание «-ая» — это русская адаптация женской формы, но в исходном мужском варианте фамилия звучала бы как Гербалинский. Встречается и вариант без «-ск-» — Гербалин, что подтверждает связь с топонимом.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с латинским herba («трава»). В таком случае фамилия могла принадлежать аптекарю, травнику или ботанику — «гербалист» (знаток трав). Однако для фамилии на «-ский» такая основа нетипична: она чаще даёт названия мест, а не профессий. Поэтому версия с географическим названием выглядит убедительнее.

Поскольку фамилия редкая, её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких родов, связанных с западными губерниями Российской империи (Беларусь, Украина, Польша). В дореволюционных метрических книгах Гербалинские могли записываться как шляхтичи или мещане. Сегодня фамилия встречается в основном в России и на Украине, но массовой не стала — это имя для тех, кто хочет докопаться до истории своего маленького рода, а не до громких титулов.