Фамилия Гермаковский, скорее всего, образована от названия населённого пункта. На Украине, в Борщевском районе Тернопольской области, существует село Гермаковка. Вероятно, родоначальник Гермаковских был выходцем оттуда. Модель образования на -ский типична для фамилий, которые давали переселенцам, переехавшим из одного места в другое: такой суффикс указывал на принадлежность к местности или владение ею.

Само название села, видимо, восходит к украинскому аналогу имени Ермак — Гермак. Имя Ермак в народной традиции считают формой крестильного имени Ермолай. В переводе с греческого Ермолай означает «вестник народа». Покровитель имени — святой мученик Ермолай, проповедовавший веру Христову и казнённый в IV веке.

Таким образом, фамилия Гермаковский — это не просто семейное прозвание, а топонимический след. Она связывает носителя с конкретным географическим местом и, через название села, с древним христианским именем.