Фамилия Глазковская — типичный пример фамилии, образованной от географического названия. Её основа — топоним Глазково. Деревни с таким именем есть в разных регионах России, но наиболее известное и вероятное для происхождения фамилии — Глазково в Иркутской области, исторически известное как Глазковское предместье Иркутска. Основатель рода Глазковских, скорее всего, был выходцем из этого или другого селения с тем же названием. Модель образования проста: к названию места добавили суффикс -ск-, указывающий на принадлежность («из Глазкова»), и окончание -ая, типичное для женской формы фамилии (в мужском варианте — Глазковский).

Вторая версия, менее правдоподобная, связывает фамилию с прозвищем Глазок. В старину так могли назвать человека с большими красивыми глазами или, наоборот, любителя подглядывать и «поглазеть». Однако для фамилий на -ский такая модель нетипична: прозвища обычно давали основу для фамилий на -ов/-ев или -ин (Глазков, Глазунов). Если бы фамилия происходила напрямую от прозвища, она звучала бы как Глазков, а не Глазковская.

В исторических источниках, в частности в работах С. Б. Веселовского, встречаются однокоренные фамилии и прозвища: князь Петр Андреевич Глазун Волконский, Григорий Андреевич Глазок Плещеев (середина XVI века), крестьянин Гридя Глазунов (1495 год, Новгород), а также Мишура Иванович Глазков (1578 год, Москва). Все они подтверждают, что корень «глаз» активно использовался в русском именослове, но ни одна из этих фамилий не имеет суффикса -ский, что косвенно подтверждает топонимическое происхождение фамилии Глазковская.

Таким образом, фамилия Глазковская — это «географическая» фамилия. Её носители — потомки людей, переселившихся из деревни Глазково и получивших прозвание по месту прежнего жительства.