Фамилия Годочкина — женская форма, мужская — Годочкин. Она образована по одной из самых распространённых русских моделей: от прозвища или имени через суффикс -к- и затем притяжательный суффикс -ин. Основа здесь — «годок». В русских говорах слово «годок» имело несколько значений. Самое вероятное — «ровесник», «однолеток». Человека, родившегося в один год с кем-то, могли прозвать Годок, а его сына или внука — Годочкин. Это типичная «семейная» фамилия, которая закрепляла родственную связь: «чей?» — Годочкин, то есть сын или потомок Годка.

Менее распространённый, но тоже возможный вариант — происхождение от слова «годок» в значении «годовалый ребёнок» или даже «годовалое животное». В этом случае прозвище могло относиться к младенцу, которого так называли в семье, или к крестьянину, державшему скот определённого возраста. Однако такая версия менее убедительна: прозвища, образованные от возраста, обычно более конкретны («Малыш», «Молодой»), а «Годок» как ровесник — более устойчивый термин в ономастике.

Фамилия редкая. Её нет в массовых списках дворянских или купеческих родов, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Годочкины — это, скорее всего, потомки людей из центральной России или Поволжья, где слово «годок» в значении «ровесник» фиксируется в диалектах. Интересно, что фамилия сохранила архаичную форму: в современном русском языке слово «годок» почти вышло из употребления, вытесненное «ровесником» или «одногодком». Таким образом, Годочкина — это живое свидетельство старых народных названий для возраста и родства, которое не попало в литературную норму, но осталось в фамилии.