Фамилия Гогусевы — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, лежит неканоническое имя или прозвище Гогус. Такие прозвища на -ус (как Марус, Якус, Петрус) были характерны для западнорусских и малороссийских земель, особенно в среде мещан и крестьян. В польском и украинском языке суффикс -ус нередко придавал имени или слову уменьшительно-ласкательный или шутливый оттенок. Таким образом, Гогус могло быть производным от имени Гога (уменьшительное от Георгий) или от прозвища, связанного с глаголом «гоготать» — то есть шумный, крикливый человек.

Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Гогусев, то есть сын или потомок Гогуса. Модель образования типична для русских фамилий, но основа явно невеликорусского звучания. Это позволяет предположить, что Гогусевы происходят из зоны культурного и языкового пограничья: из белорусских, украинских или южнорусских губерний, где бытовали подобные формы личных имён.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с тюркским корнем «гогус» или «кокус» — «синий», «голубой». В таком случае прозвище могло указывать на цвет глаз или одежды. Однако для этой гипотезы нет прямых исторических подтверждений, и она уступает первой по распространённости подобных моделей в русской ономастике.

В дореволюционных источниках фамилия Гогусевы встречается эпизодически, в основном в переписях крестьянского и мещанского сословий центральных и южных губерний. Ярких исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано, что говорит о её «народном», а не дворянском происхождении. Фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной, сохранив в своей основе память о прозвище конкретного человека — возможно, бойкого или голосистого предка.