Фамилия Голаникова — женская форма фамилии Голаников, и её разбор стоит начать не с корня, а с редкого суффикса. В русских фамилиях суффикс -ик- встречается нечасто: обычно он указывает на уменьшительную или профессиональную форму имени или прозвища. В основе фамилии лежит прозвище Голаник, которое могло означать «голый, бедный человек» или «лысый». Слово «голый» в древнерусских говорах имело широкий спектр значений: от «неимущий» до «не имеющий растительности на голове». Таким образом, Голаник — это человек, которого прозвали за отсутствие чего-либо (денег, волос, одежды). Суффикс -ик придаёт прозвищу оттенок постоянного признака: не просто голый, а тот, кто всегда таков.

Вторая версия, менее очевидная, но возможная: происхождение от имени Голан, которое могло быть заимствовано из иврита (Голан — название местности) или же быть вариантом канонического имени Галактион. Однако в русской среде такая основа маловероятна без дополнительных свидетельств: фамилия Голаников не фиксируется в старых переписных книгах среди духовенства или купечества, где чаще встречались «книжные» имена. Поэтому версия с прозвищем от «голый» — основная и правдоподобная.

Географически фамилия Голаников встречается разрозненно, без ярко выраженного «гнезда». По данным современных телефонных справочников и баз, носители живут в центральных областях России, а также на Урале и в Сибири, что характерно для фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей, которые в XIX веке мигрировали за Урал. Сословно предки Голаниковых, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами: в дворянских родословных книгах фамилия не значится.

Словообразовательная модель проста: к основе Голаник- добавляется типичный русский суффикс -ов, образующий притяжательные фамилии («чей?» — сын Голаника). Женская форма Голаникова — естественное грамматическое изменение. В отличие от фамилий на -ин, где основа часто оканчивается на -а или -я, здесь суффикс -ов указывает на мужскую основу с согласным на конце. Это стандартный, но не единственный вариант: если бы прозвище звучало как Голаниха, фамилия была бы Голанихин. Выбор суффикса -ов подтверждает, что исходное прозвище было именно Голаник, а не Голаниха.

Однокоренные фамилии — Голов, Голый, Голубев — сходны по смыслу, но не по форме. Голаников стоит особняком из-за суффикса -ик, который делает фамилию узнаваемой и редкой. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегана) модель на -иков упоминается как одна из малопродуктивных, что объясняет редкость фамилии.