Фамилия Голышкина — женская форма фамилии Голышкин, которая образовалась от прозвища Голышка. В основе лежит нарицательное «голь» или «голынь», то есть «бедность, нищета». Прямое значение прозвища указывает на социальное положение: основатель фамилии мог быть бедняком, а в некоторых случаях — разорившимся дворянином, потерявшим состояние.

Но у этой фамилии есть и вторая, менее очевидная версия происхождения. В народной среде прозвище Голышка могло выполнять «охранительную» функцию — служить оберегом. Родители намеренно давали ребёнку «бедное» имя, чтобы отвести от него зависть и сглаз, надеясь, что на самом деле он вырастет богатым и благополучным. Таким образом, прозвище не всегда отражало реальную нужду — иногда это была магическая подстраховка.

В исторических источниках фамилия встречается с XVI века. С. Б. Веселовский упоминает Данилу Голыша, холопа из Новгорода (1603 год), и крестьянина Никуду Голышева из Моски (1638 год). Эти записи показывают, что прозвище бытовало в разных слоях общества — и среди зависимых крестьян, и среди вольных людей.

Суффикс -к- в основе Голышка указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму, распространённую в северных и центральных русских говорах. Со временем прозвище закрепилось за человеком как основное именование, а затем, через притяжательный суффикс -ин, перешло в фамилию. Выходит, что Голышкина — это буквально «жена или дочь Голышки».

Интересно, что однокоренные фамилии — Голышев, Гольцов, Голый — имеют ту же основу, но разные суффиксы. Голышкина выделяется именно уменьшительным оттенком, который мог смягчать резкое значение «голь» и делать прозвище более бытовым, почти ласковым.