Фамилия Голышко — характерный пример восточнославянской модели с уменьшительным суффиксом -к-. В основе лежит прозвище Голыш, которое в разных говорах имело несколько значений. Самое прямое и распространенное — «бедняк, не имеющий ничего за душой», то есть голый человек. В некоторых диалектах голышом называли непокрытую голову, лысого, а также камень-голыш, что могло указывать на твердый или упрямый характер. Выбор суффикса -к- в сочетании с окончанием -о типичен для украинской и южнорусской традиции образования фамилий: так же сложились фамилии Малышко, Жданко, Шевченко. В северных и центральных областях России от того же прозвища чаще образовывали фамилию Голышев или Голышов.

Слово «голыш» в русских говорах фиксируется с XVII века. В документах того времени встречаются крестьяне и посадские люди с таким прозвищем. Например, в переписных книгах упоминается Голышко — не фамилия, а личное именование, от которого потом и пошла фамилия. Это значит, что предок носителя фамилии Голышко, скорее всего, был человеком незнатного происхождения — крестьянином или ремесленником, которого окружающие прозвали за бедность или какую-то особенность внешности.

Интересно, что фамилия Голышко географически привязана в основном к современной Украине и югу России. Встречается она и у белорусов, но реже. В русских переписях XIX века носители фамилии фиксировались в Курской, Воронежской, Харьковской губерниях — то есть в зоне смешения украинского и русского населения. Это объясняет и суффикс, и окончание: модель на -ко там была обычной для всех сословий.

Других версий происхождения, заслуживающих серьезного внимания, нет. Иногда фамилию пытаются связать с польским golysz — «голыш, бедняк», но это тот же корень, только в другой языковой среде. По сути, значение везде одно: указание на отсутствие богатства или на гладкую, «голую» поверхность. Фамилия недвусмысленная, без тайн, но зато прямо говорит о бытовой наблюдательности тех, кто давал прозвища несколько веков назад.