Фамилия Гоматин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если разбирать её по словообразовательной модели, то перед нами типичная русская фамилия с патронимическим суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Гоматин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Гомата. Основа здесь — Гомат-, и именно в ней кроется главная загадка.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «гомонить» — говорить, шуметь, галдеть. В северных и центральных говорах слово «гомон» означало шум, гам, неразборчивую речь. Соответственно, Гомата — это человек, который гомонит: крикливый, шумный, возможно, болтливый. Суффикс -ат- в прозвище типичен для характеристики человека по яркому внешнему признаку или поведению (сравните: борода — бородатый, горб — горбатый, гомон — гоматый). Усечение основы до «Гомат» — естественный разговорный процесс.

Менее вероятна, но возможна связь с украинским или белорусским корнем «гомій» (гомон, гул) или с польским gomat (путаница, неразбериха). В любом случае, смысл остаётся в той же семантической области — что-то связанное с шумом, голосом или невнятной речью.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к северо-западу России и к бывшим новгородским землям, где слово «гомонить» было особенно употребительно. Встречается она редко, в основном в Вологодской, Архангельской и Костромской областях, а также среди староверов.

Словообразовательная модель «основа глагола/существительного + -ат- + -ин» — старая и архаичная. Большинство фамилий на -атин (Пугатин, Губатин, Лопатин) образованы именно от прозвищ, описывающих внешность или характер. Фамилия Гоматин стоит в этом ряду, но с уклоном в характеристику голоса и поведения, а не внешности. В официальных документах XIX века носители фамилии встречаются среди крестьян и мещан, что подтверждает её народное, недворянское происхождение.