Фамилия Гондусов, вероятно, образована от имени Гонда – венгерской краткой формы имени Конрад. Это германское имя состоит из двух компонентов: kvon, что в переводе с немецкого означает «отважный, смелый, храбрый», и rad, то есть «намерение, желание, цель». Это имя знаменитого в X веке епископа из Швейцарии; также его носили несколько германских королей. Компонент –ус в данном случае представляет собой украинский уменьшительный суффикс, который использовался при образовании форм имен. Родственная фамилия Гондус встречается преимущественно на Украине, поэтому, вероятно, основатель рода Гондусовых был выходцем из Венгрии, который переехал на Украину. Согласно другой версии, фамилия Гондусов образована от прозвища Гондус, которое восходит к старопольскому глаголу gǫdzić - «играть на каком-либо музыкальном инструменте». Следовательно, основатель рода Гондусовых мог быть музыкантом.