Фамилия Гонобобова — женская форма фамилии Гонобобов, а та в свою очередь ведет начало от прозвища или нецерковного имени Гонобоб. Основа здесь — диалектное слово «гонобобель» или «гонобоб», так в ряде русских говоров называют ягоду голубику. В Вологодской, Архангельской, Пермской губерниях и в Сибири голубицу до сих пор зовут гонобобом, гонобобелем или гонобобником. Слово это скорее всего звукоподражательное: по поверью, от этой ягоды «гонит боб» — кружится и болит голова, хотя современная наука связывает недомогание с багульником, который часто растет рядом с голубикой.

Прозвище Гонобоб могли дать человеку по нескольким причинам. Самая прямая — за любовь к этой ягоде, за то, что часто ее собирал или торговал ею. В северных деревнях голубика была важным подспорьем, особенно в неурожайные годы. Но возможен и переносный смысл: так могли назвать суетливого, беспокойного человека — от того же глагольного ощущения «гонобоб» как чего-то, что мутит и кружит. Вторая версия менее вероятна, но не исключена: в некоторых говорах «гонобобом» называли не только ягоду, но и самого собирателя, промышляющего ею.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе на твердый согласный добавлен суффикс принадлежности -ов (Гонобоб + ов), потом появилась женская форма с окончанием -а. Суффикс указывает на типичное происхождение: «чей?» — Гонобобов, то есть сын или потомок Гонобоба. Фамилия редкая, географически привязана к северу и северо-востоку европейской России, а также к Уралу и Сибири — именно там, где растет голубика и где в ходу это ее народное название.

Сословно Гонобобовы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилии на -ов от прозвищ, не связанных с официальными именами или ремеслами, типичны для непривилегированных слоев. В дворянскую среду такая «ягодная» фамилия вряд ли попала, хотя единичные исключения возможны. В документах XVII—XVIII веков упоминания единичны: например, в переписных книгах Соликамского уезда встречается крестьянин Гонобоб, но систематических списков носителей нет.

Интересно, что фамилия почти не имеет однокоренных «конкурентов» в русском ономастиконе. Гонобобов — самостоятельный вариант, не смешиваемый с Голубевым или Черничным. Это делает её хорошим маркером происхождения: если человек носит фамилию Гонобобова, его предки почти наверняка жили в зоне распространения северных говоров — на Вологодчине, в Архангельской области или на Урале.