Фамилия Гонштеин — редкий случай, когда в русском именослове почти наверняка закрепилось немецкое или еврейское написание, а не славянская основа. Внешне фамилия похожа на искусственно составленную из двух корней, но на деле это, скорее всего, вариант фамилии Гонштейн, записанный через «еи» под влиянием немецкого дифтонга «ei», который в русской передаче XIX века могли фиксировать как «ей» или «еи». Если исходить из этой версии, основа фамилии — немецкое «Stein» (камень) и первая часть, которая может восходить к «Gon-» — либо к диалектному варианту личного имени (например, Гонцель, уменьшительное от Гонтер), либо к географическому названию. В еврейской традиции Гонштейн — это вариант фамилии, образованной от названия местности (например, Гонстен или Гонштайн в Германии), где «-штейн» — типичный топонимический суффикс, указывающий на «камень» или «скалу».

Модель образования здесь не славянская: нет суффиксов -ов, -ин, -ский, которые крестьяне или мещане получали по отцу или прозвищу. Гонштеин — это фамилия-топоним, то есть её носитель или его предок происходил из места, в названии которого был корень «штейн». В Российской империи такие фамилии чаще всего встречались у еврейского населения западных губерний (Беларусь, Украина, Прибалтика), где немецкое влияние через идиш и канцелярский язык было сильным. Также возможен вариант, что фамилия принадлежала немецким колонистам, переселившимся в Россию в XVIII–XIX веках, но в таком случае написание обычно фиксировалось как Штейн или Штейнер, а Гонштеин — более редкая огласовка.

Известных носителей с такой записью почти нет, что говорит о крайней редкости фамилии даже в исторических документах. Если вы ищете свои корни, стоит смотреть в сторону метрических книг еврейских общин Волынской, Подольской или Киевской губерний, а также списков немецких колонистов Поволжья. Вероятнее всего, предки были ремесленниками или мелкими торговцами, так как фамилия не указывает на дворянское происхождение или принадлежность к духовенству. В любом случае, Гонштеин — это фамилия-загадка, где написание важнее звучания, и именно оно выдаёт её нерусское происхождение.