Фамилия Граховская принадлежит к распространённому типу русских фамилий на -ский/-цкий, которые чаще всего носили дворяне, духовенство или выходцы из западнорусских земель (современные Беларусь, Украина, Польша). В отличие от фамилий на -ов/-ин, образованных от имени или прозвища отца, модель на -ский указывала на связь с географическим объектом — селом, городом или урочищем. Носитель фамилии Граховский (женская форма — Граховская) мог получить её по названию места, откуда он родом или которым владел.

Основа фамилии — «Грахов-» — почти наверняка связана с топонимом. В России и сопредельных странах есть несколько населённых пунктов с корнем «Грах-»: например, село Грахово в Удмуртии (известное с XVII века) или деревня Грахово в Смоленской области. В польской и белорусской традиции возможна связь с названием Граховичи (такие деревни есть в Брестской и Гродненской областях). Сам топоним, скорее всего, произошёл от прозвища или имени Грах — народной формы крестильного имени Агафон (от греческого «агатос» — добрый) или, реже, от слова «грах» (горох) в южнорусских говорах. То есть предок мог быть либо «гороховым» (сеял горох или торговал им), либо носителем уменьшительного имени.

Суффикс -ск- в фамилии Граховская — типичный признак фамилий, которые оформлялись в XV–XVII веках у служилого дворянства по названию вотчины, а позже — у духовенства по названию прихода или семинарии. Если предки были священниками, фамилию могли дать в семинарии по селу, где служил отец. Если дворянами — по поместью. Учитывая, что фамилия не самая частая, её носители, вероятно, происходят из одного компактного региона — скорее всего, из центральной России или Поволжья, где встречаются соответствующие топонимы.

Интересная деталь: в русских говорах слово «грах» иногда означало «грохот», «шум» — от глагола «грахать» (греметь). Но эта версия менее вероятна для фамилии, так как прозвища от действий («Грах» — тот, кто гремит) редко становились основой для топонимических фамилий на -ский. В любом случае, современные носительницы фамилии Граховская могут считать себя потомками либо землевладельцев из села с «гороховым» или «именным» названием, либо священников, чей приход стоял на речке или урочище с похожим корнем.