Фамилия Губертов — одна из тех, что образована напрямую от названия должности или звания, а не от имени или прозвища. В её основе лежит слово «губерт» — искажённое «губернатор». В русской устной речи, особенно в простонародной среде XVIII–XIX веков, «губертом» могли называть губернатора, начальника губернии. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Губертов — буквально «сын губерта» или «человек из семьи того, кого прозвали Губертом».

Скорее всего, прозвище Губерт давали не самому губернатору, а его слуге, крепостному, приказчику или даже человеку, который работал в губернском правлении. В народе могли так назвать и того, кто держался важно, любил командовать или подражал манерам начальства. Другая, менее вероятная версия — что фамилия восходит к немецкому имени Hubert, которое в немецких колониях России иногда записывали как Губерт, а затем русифицировали через суффикс -ов. Но для фамилии Губертов, в отличие от Губерта, эта гипотеза слабее: русская модель образования через -ов (чей? — Губертов) типична для прозвищ и отчеств, а не для прямого заимствования немецкой фамилии.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также в Поволжье. В дореволюционных переписях Губертовы фиксировались среди крестьян и мещан. Интересная деталь: в некоторых говорах слово «губерт» могло означать не только губернатора, но и вообще важного, строгого человека — и тогда прозвище могло закрепиться за старостой или управляющим.

Сравните с однокоренными фамилиями: Губернаторов — более прямая и редкая, Губернский — с суффиксом принадлежности к месту, и Губертов — самая «народная» по звучанию. Она показывает, как официальный титул адаптировался в крестьянской среде: из «губернатора» вышло короткое «губерт», а из него — фамилия, которая звучит почти как отчество.