Фамилия Губушкин — один из тех случаев, когда на слух всё прозрачно, а на деле кроется неожиданность. Первое, что приходит в голову: основа «губ-» и суффикс «-ушк-» явно указывают на что-то маленькое, ласкательное. Но если бы фамилия была образована напрямую от слова «губа» (часть лица), мы бы ждали форму Губин или Губкин. Суффикс «-ушкин» здесь — не уменьшительный, а притяжательный, указывающий на принадлежность.

На самом деле Губушкин — это отчество от прозвища или неканонического имени Губушка. А вот что такое «Губушка» — вопрос. В русских говорах «губой» называли не только рот, но и гриб (губа — старинное название гриба-трутовика), а также нечто выпуклое, округлое. Прозвище Губушка мог получить человек с пухлыми губами, с характерной формой лица или, что вероятнее, грибник, любитель «губ» (грибов). В словаре русских народных говоров зафиксировано слово «губник» — любитель грибов, и «губушка» — ласковое название гриба.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным «губить» (портить, уничтожать). Тогда Губушка — тот, кто «губит», например, вредитель или нерадивый работник. Однако прозвища от глаголов с суффиксом «-ушк-» встречаются редко, и чаще они образуются от существительных.

По географии фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России — там, где слово «губа» в значении «гриб» было в ходу. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: вероятно, один род в конкретной местности дал начало всем носителям. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян с прозвищем Губка, Губушка — это была живая, бытовая форма, которая потом закрепилась как фамилия.

Таким образом, предок Губушкиных — не обязательно человек с выдающимися губами. Скорее всего, он был грибником, знатоком леса, и его прозвище передалось потомкам в форме отчества. Суффикс «-ин» в конце — стандартный русский патронимический показатель (чей? — Губушкин), поэтому фамилия органично вписалась в модель крестьянских и мещанских родов.