Фамилия Гунзеров — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает все остальные версии. Основа здесь — «гунзер» или «гунза», и искать её происхождение нужно не в славянских наречиях, а в тюркских или финно-угорских языках Поволжья и Приуралья. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища, данного по месту жительства или по национальной принадлежности предка.

Слово «гунза» в некоторых тюркских диалектах означает «кувшин» или «сосуд», но для прозвища это маловероятно. Куда убедительнее связь с этнонимом «гунны» или с названием реки Гунза (приток Камы в Удмуртии). В таком случае Гунзер — это человек, живший на реке Гунза, или выходец из тех мест, где бытовало это название. Суффикс «-ер» в русских фамилиях нетипичен, но для тюркских заимствований возможен: он мог возникнуть как адаптация местного окончания или как указание на род занятий (ср. «гончар», «столяр»), но применительно к «гунзе» это маловероятно.

Словообразовательная модель проста: основа «гунзер-» плюс патронимический суффикс «-ов». Это значит, что фамилию дали по отцу: сын Гунзера. Сам Гунзер — это либо прозвище, либо имя, данное при крещении (но в святцах такого имени нет, значит, это именно бытовое, нецерковное имя). Вторая, более слабая версия — связь с немецким словом Gunzer (от Gunz — «отвага»), но она держится только на внешнем сходстве: никаких следов немецких колонистов с такой фамилией в документах не найдено.

Географически фамилия Гунзеров тяготеет к востоку европейской части России: встречается в Пермском крае, Удмуртии, Татарстане. Именно в этих регионах протекает река Гунза, и именно там исторически смешивались русские, тюркские и финно-угорские группы населения. Поэтому наиболее правдоподобно, что предок носителя фамилии был либо выходцем с реки Гунза, либо получил прозвище по этническому признаку (от «гуннов» — условное обозначение кочевников в русских летописях). В любом случае, фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, и её редкость говорит о локальном, почти семейном происхождении.