Фамилия Гусенкова — женская форма распространённой фамилии Гусенков. В её основе лежит прозвище или мирское имя Гусь. Называли так не случайно: Гусем могли прозвать человека за длинную шею, грузную походку или за то, что он пас или продавал гусей. В древнерусской традиции такие имена-прозвища давали не в насмешку, а как оберег или по роду занятий — это обычная практика доцерковной эпохи.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Фамилия образована не напрямую от прозвища Гусь с помощью суффикса -ов (Гусь → Гусев), а через украинскую или южнорусскую форму Гусенко. Суффикс -енко (уменьшительно-патронимический) характерен для восточноукраинских и белорусских земель: он указывал на «малого» или «сына» — в данном случае Гусенко означало «сын Гуся». Когда носители этой фамилии переселялись в центральную Россию, фамилию адаптировали к местной норме, добавив русский суффикс -ов: Гусенко → Гусенков. Таким образом, фамилия Гусенкова — результат двойной русификации: сначала прозвище превратилось в украинский патроним, а затем тот «обрусел» окончательно.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и южных регионах России, а также в областях, куда в XVIII–XIX веках переселялись малороссийские крестьяне. В документах XVII века можно найти однокоренные фамилии — Гусев, Гусин, Гусаков, но Гусенков выделяется именно своим «украинским следом» в основе.