Фамилия Иерусалимцев — яркий пример так называемых «семинарских» или «искусственных» фамилий, которые в массе своей появились в духовном сословии России в конце XVII–XIX веках. Её основа — топоним Иерусалим (город в Израиле, священный для трёх мировых религий). Суффикс -ев в сочетании с окончанием указывает на модель притяжательного прилагательного: Иерусалимцев буквально значит «чей? — Иерусалимов», то есть потомок человека, носившего прозвище или «фамильное имя» Иерусалим.

Почему будущий священник или его сын получал такую фамилию? В духовных училищах и семинариях было принято давать ученикам «благозвучные» фамилии по названиям библейских мест, церковных праздников или имён святых. Иерусалим — центральное понятие христианской географии, поэтому фамилия Иерусалимов, Иерусалимский или Иерусалимцев была вполне естественной для выпускника. Вариант с суффиксом -цев (а не -ский) встречается реже и, вероятно, образован по более простой бытовой модели: от прозвища Иерусалимец — «тот, кто связан с Иерусалимом», возможно, паломник или человек, побывавший в Святой Земле. Однако для семинарской среды типичнее именно «книжное» происхождение: преподаватель или архиерей, давая фамилию, мог просто записать ученика Иерусалимцевым, не вникая в реальные обстоятельства его жизни.

Географически фамилия рассеяна по России без ярко выраженного гнезда, что тоже подтверждает её искусственный характер: её носители — потомки выходцев из разных епархий, где были духовные школы. Встречается она в основном в центральных областях, на Урале и в Сибири, куда переселялись священники и их дети. Известно, что в XIX веке фамилию Иерусалимцев носили несколько священнослужителей, например, в Тобольской и Пермской епархиях, что дополнительно указывает на её сословные корни.

Таким образом, для большинства носителей фамилии Иерусалимцев ответ на вопрос «кем были предки» однозначен: скорее всего, выходцами из духовного сословия, а сама фамилия — не прозвище по месту жительства, а «благозвучное» наименование, полученное предком в семинарии или при рукоположении.